長崎県に被害を及ぼす地震は、主に陸域や沿岸部の浅い場所で発生する地震と太平洋側沖合で発生する地震です。
浅いところで発生した被害地震としては、１７００年の壱岐・対馬付近の地震（Ｍ７．０）、１７９２年の島原半島の地震（Ｍ６．４）、１９２２年の島原（千々石湾）地震（Ｍ６．９、Ｍ６．５）などがあります。このうち１７００年の地震では、壱岐及び対馬で被害が大きく、特に壱岐では石垣や墓石がことごとく崩れ、家屋も大半が崩壊しました。佐賀や平戸でも瓦が落ちるなどの被害が生じました。震源の詳細は不明ですが、被害状況から壱岐近海と推定されています。なお、朝鮮半島でも被害が生じたことから判断すると、対馬の西方に震源があったとも考えられます。壱岐対馬の近海には海底に活断層がある可能性があります。
　１７９２年の島原半島の地震は雲仙普賢岳の噴火活動に伴って発生しました。１７９２年４月頃より島原半島周辺で有感地震が頻発し、５月２１日にはＭ６．４の最大の地震が発生しました。この地震が引き金となって古い溶岩ドームである眉山（当時前山）の一部が大崩壊しました。崩壊した山体は有明海に流れこんで津波を発生させ、有明海沿岸に甚大な被害を及ぼしました。この噴火活動の前から島原半島西部～千々石湾（橘湾）付近を震源とする群発地震活動があり、１７９１年１２月の地震では島原半島西部の小浜で家屋が倒壊して２名が死亡しました。
(中略)長崎県では、このほか１６５７年の地震（Ｍ不明、長崎で被害大）、１７２５年の地震（Ｍ６．０、長崎、平戸で被害あり）、１８２８年の地震（Ｍ６．０、天草、長崎、五島で被害あり）などで被害が生じました。
　周辺地域の浅いところで発生した規模の大きな地震によって被害を受けることもあります。例えば、１８８９年の熊本の地震（Ｍ６．３）では、島原半島の眉山に山崩れがありました。
　長崎県では、南海トラフ沿いの巨大地震のなかで、四国沖から紀伊半島沖が震源域となった場合、津波による浸水や地震の揺れなどによる被害を受けることがあります。例えば、１７０７年の宝永地震（Ｍ８．６）では津波による浸水被害が長崎市で生じました。また、１８５４年の安政南海地震（Ｍ８．４）や１９４６年の南海地震（Ｍ８．０）でも、家屋への被害が生じました。
　長崎県の主要な活断層は、島原湾から島原半島を経て橘湾まで延びる雲仙断層群があります。短い活断層としては多良岳南西麓断層帯があります。
　また、長崎県周辺に震源域のある海溝型地震はありませんが、南海トラフ沿いの巨大地震で被害を受ける可能性もあります。諫早湾の干拓地周辺はやや弱い地盤であるため、地震が発生した場合には他の地域より揺れが大きくなる可能性があります。
http://www.jishin.go.jp/main/yosokuchizu/kyushu-okinawa/p42_nagasaki.htm